##
## PHAT-SiRUP
##

# Step 0: input
./phat-sirup-exe \
 --ascii \
 --standard \
 --bmat_in example_3_1.bmat \
 --bmat_out example_3_1_a.bmat \
 --opmat_out example_3_1_a.opmat \
 --pairs_out example_3_1_a.pairs

# Step 1: remove 12
./phat-sirup-exe \
 --ascii \
 --standard \
 --dont_reduce \
 --updates example_3_1_a.update \
 --bmat_in example_3_1_a.bmat \
 --bmat_out example_3_1_b.bmat \
 --opmat_in example_3_1_a.opmat \
 --opmat_out example_3_1_b.opmat \
 --pairs_out example_3_1_b.pairs

# Step 2: remove 10
./phat-sirup-exe \
 --ascii \
 --standard \
 --dont_reduce \
 --updates example_3_1_b.update \
 --bmat_in example_3_1_b.bmat \
 --bmat_out example_3_1_c.bmat \
 --opmat_in example_3_1_b.opmat \
 --opmat_out example_3_1_c.opmat \
 --pairs_out example_3_1_c.pairs
 
##
## GUDHI example file
##

./example_3_1_gudhi